Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2R9

SSBP3-AS1, Putative uncharacterized protein SSBP3-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP3-AS1Q7Z2R9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms