Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTV0

PHF5A, PHD finger-like domain-containing protein 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF5AQ7RTV0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF5AQ7RTV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF5AQ7RTV0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHF5AQ7RTV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF5AQ7RTV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHF5AQ7RTV0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF5AQ7RTV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHF5AQ7RTV0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF5AQ7RTV0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms