Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
STRCQ7RTU9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
STRCQ7RTU9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
STRCQ7RTU9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.9■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
STRCQ7RTU9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
STRCQ7RTU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
STRCQ7RTU9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
STRCQ7RTU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
STRCQ7RTU9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
STRCQ7RTU9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
STRCQ7RTU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
STRCQ7RTU9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
STRCQ7RTU9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
STRCQ7RTU9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
STRCQ7RTU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
STRCQ7RTU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
STRCQ7RTU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
STRCQ7RTU9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
STRCQ7RTU9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
STRCQ7RTU9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
STRCQ7RTU9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
STRCQ7RTU9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
STRCQ7RTU9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
STRCQ7RTU9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
STRCQ7RTU9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
STRCQ7RTU9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
STRCQ7RTU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
STRCQ7RTU9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
STRCQ7RTU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
STRCQ7RTU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
STRCQ7RTU9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
STRCQ7RTU9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
STRCQ7RTU9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
STRCQ7RTU9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
STRCQ7RTU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
STRCQ7RTU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
STRCQ7RTU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
STRCQ7RTU9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
STRCQ7RTU9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
STRCQ7RTU9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms