Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
OTOP1Q7RTM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
OTOP1Q7RTM1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
OTOP1Q7RTM1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
OTOP1Q7RTM1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
OTOP1Q7RTM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OTOP1Q7RTM1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OTOP1Q7RTM1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
OTOP1Q7RTM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
OTOP1Q7RTM1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
OTOP1Q7RTM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
OTOP1Q7RTM1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
OTOP1Q7RTM1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms