Protein–RNA interactions for Protein: Q7L273

KCTD9, BTB/POZ domain-containing protein KCTD9, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD9Q7L273 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD9Q7L273 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD9Q7L273 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD9Q7L273 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCTD9Q7L273 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD9Q7L273 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCTD9Q7L273 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCTD9Q7L273 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD9Q7L273 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD9Q7L273 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms