Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG6

FP248, Putative chemokine-related protein FP248, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FP248Q71RG6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FP248Q71RG6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FP248Q71RG6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FP248Q71RG6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FP248Q71RG6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms