Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP34Q70CQ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP34Q70CQ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP34Q70CQ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP34Q70CQ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP34Q70CQ2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms