Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVX7

NCCRP1, F-box only protein 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCCRP1Q6ZVX7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCCRP1Q6ZVX7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCCRP1Q6ZVX7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCCRP1Q6ZVX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCCRP1Q6ZVX7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCCRP1Q6ZVX7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCCRP1Q6ZVX7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCCRP1Q6ZVX7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCCRP1Q6ZVX7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCCRP1Q6ZVX7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCCRP1Q6ZVX7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCCRP1Q6ZVX7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCCRP1Q6ZVX7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCCRP1Q6ZVX7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms