Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf139Q6ZV77 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf139Q6ZV77 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf139Q6ZV77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf139Q6ZV77 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf139Q6ZV77 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms