Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIPOR1Q6ZS17 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIPOR1Q6ZS17 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPOR1Q6ZS17 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPOR1Q6ZS17 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPOR1Q6ZS17 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms