Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00322Q6ZN03 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00322Q6ZN03 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00322Q6ZN03 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00322Q6ZN03 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00322Q6ZN03 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms