Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM198BQ6UWH4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM198BQ6UWH4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM198BQ6UWH4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM198BQ6UWH4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM198BQ6UWH4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM198BQ6UWH4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms