Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FIP1L1Q6UN15 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FIP1L1Q6UN15 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FIP1L1Q6UN15 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FIP1L1Q6UN15 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FIP1L1Q6UN15 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms