Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SARM1Q6SZW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SARM1Q6SZW1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SARM1Q6SZW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SARM1Q6SZW1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SARM1Q6SZW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SARM1Q6SZW1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SARM1Q6SZW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SARM1Q6SZW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SARM1Q6SZW1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SARM1Q6SZW1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SARM1Q6SZW1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SARM1Q6SZW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SARM1Q6SZW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms