Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S3Q6QNY0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BLOC1S3Q6QNY0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S3Q6QNY0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BLOC1S3Q6QNY0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BLOC1S3Q6QNY0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BLOC1S3Q6QNY0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BLOC1S3Q6QNY0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BLOC1S3Q6QNY0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S3Q6QNY0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms