Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFWD3Q6PCD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFWD3Q6PCD5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFWD3Q6PCD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFWD3Q6PCD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFWD3Q6PCD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFWD3Q6PCD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms