Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3W7

SCYL2, SCY1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL2Q6P3W7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCYL2Q6P3W7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCYL2Q6P3W7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCYL2Q6P3W7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCYL2Q6P3W7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCYL2Q6P3W7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCYL2Q6P3W7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCYL2Q6P3W7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCYL2Q6P3W7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCYL2Q6P3W7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCYL2Q6P3W7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCYL2Q6P3W7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms