Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF544Q6NX49 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF544Q6NX49 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF544Q6NX49 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF544Q6NX49 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF544Q6NX49 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms