Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRPF40BQ6NWY9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PRPF40BQ6NWY9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PRPF40BQ6NWY9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRPF40BQ6NWY9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PRPF40BQ6NWY9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRPF40BQ6NWY9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRPF40BQ6NWY9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms