Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC70Q6NSX1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC70Q6NSX1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC70Q6NSX1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC70Q6NSX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC70Q6NSX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC70Q6NSX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC70Q6NSX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms