Protein–RNA interactions for Protein: Q5W188

CST9LP1, Putative cystatin-9-like protein CST9LP1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9LP1Q5W188 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CST9LP1Q5W188 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CST9LP1Q5W188 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CST9LP1Q5W188 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CST9LP1Q5W188 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CST9LP1Q5W188 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CST9LP1Q5W188 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CST9LP1Q5W188 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CST9LP1Q5W188 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST9LP1Q5W188 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CST9LP1Q5W188 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CST9LP1Q5W188 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CST9LP1Q5W188 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CST9LP1Q5W188 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CST9LP1Q5W188 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CST9LP1Q5W188 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CST9LP1Q5W188 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CST9LP1Q5W188 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms