Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND4CQ5VZ89 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DENND4CQ5VZ89 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DENND4CQ5VZ89 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND4CQ5VZ89 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND4CQ5VZ89 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND4CQ5VZ89 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms