Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXB2Q5VYV0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXB2Q5VYV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXB2Q5VYV0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXB2Q5VYV0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXB2Q5VYV0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXB2Q5VYV0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms