Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC18Q5T9S5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC18Q5T9S5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC18Q5T9S5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC18Q5T9S5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC18Q5T9S5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC18Q5T9S5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CCDC18Q5T9S5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC18Q5T9S5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC18Q5T9S5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC18Q5T9S5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC18Q5T9S5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC18Q5T9S5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC18Q5T9S5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC18Q5T9S5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
CCDC18Q5T9S5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CCDC18Q5T9S5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC18Q5T9S5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.19■■■■■ 4.19
CCDC18Q5T9S5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
CCDC18Q5T9S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CCDC18Q5T9S5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CCDC18Q5T9S5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC18Q5T9S5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC18Q5T9S5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC18Q5T9S5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CCDC18Q5T9S5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CCDC18Q5T9S5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms