Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIVEP3Q5T1R4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIVEP3Q5T1R4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIVEP3Q5T1R4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIVEP3Q5T1R4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIVEP3Q5T1R4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIVEP3Q5T1R4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIVEP3Q5T1R4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIVEP3Q5T1R4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms