Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SAPCD1Q5SSQ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAPCD1Q5SSQ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAPCD1Q5SSQ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SAPCD1Q5SSQ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAPCD1Q5SSQ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAPCD1Q5SSQ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms