Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2D4BQ5SQS7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2D4BQ5SQS7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D4BQ5SQS7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH2D4BQ5SQS7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH2D4BQ5SQS7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH2D4BQ5SQS7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms