Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNT1Q5JUK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNT1Q5JUK3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNT1Q5JUK3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNT1Q5JUK3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNT1Q5JUK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNT1Q5JUK3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNT1Q5JUK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNT1Q5JUK3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNT1Q5JUK3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNT1Q5JUK3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNT1Q5JUK3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNT1Q5JUK3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNT1Q5JUK3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms