Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB2Q5IJ48 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRB2Q5IJ48 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB2Q5IJ48 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRB2Q5IJ48 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRB2Q5IJ48 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms