Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF628Q5EBL2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF628Q5EBL2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF628Q5EBL2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF628Q5EBL2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF628Q5EBL2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF628Q5EBL2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF628Q5EBL2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF628Q5EBL2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF628Q5EBL2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF628Q5EBL2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF628Q5EBL2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms