Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZC3H12AQ5D1E8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZC3H12AQ5D1E8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZC3H12AQ5D1E8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZC3H12AQ5D1E8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZC3H12AQ5D1E8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms