Protein–RNA interactions for Protein: Q5BIV9

SPRN, Shadow of prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRNQ5BIV9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRNQ5BIV9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRNQ5BIV9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRNQ5BIV9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPRNQ5BIV9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPRNQ5BIV9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms