Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDNFQ49AH0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDNFQ49AH0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDNFQ49AH0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDNFQ49AH0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms