Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30BQ3MIR4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30BQ3MIR4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM30BQ3MIR4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms