Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms