Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD55Q3KP44 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD55Q3KP44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD55Q3KP44 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD55Q3KP44 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD55Q3KP44 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms