Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-DRB5Q30154 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-DRB5Q30154 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DRB5Q30154 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-DRB5Q30154 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLA-DRB5Q30154 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DRB5Q30154 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DRB5Q30154 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DRB5Q30154 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DRB5Q30154 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DRB5Q30154 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DRB5Q30154 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms