Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UVSSAQ2YD98 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
UVSSAQ2YD98 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UVSSAQ2YD98 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UVSSAQ2YD98 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UVSSAQ2YD98 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UVSSAQ2YD98 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms