Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VMACQ2NL98 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VMACQ2NL98 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VMACQ2NL98 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VMACQ2NL98 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VMACQ2NL98 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VMACQ2NL98 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms