Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSR1Q2NL82 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSR1Q2NL82 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSR1Q2NL82 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR1Q2NL82 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSR1Q2NL82 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSR1Q2NL82 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR1Q2NL82 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSR1Q2NL82 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR1Q2NL82 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSR1Q2NL82 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSR1Q2NL82 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSR1Q2NL82 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSR1Q2NL82 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms