Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRNQ16849 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRNQ16849 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRNQ16849 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRNQ16849 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRNQ16849 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRNQ16849 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRNQ16849 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
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