Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPROQ16827 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPROQ16827 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPROQ16827 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPROQ16827 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPROQ16827 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPROQ16827 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPROQ16827 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
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