Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFA9Q16795 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFA9Q16795 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFA9Q16795 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFA9Q16795 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFA9Q16795 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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