Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FOXD1Q16676 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FOXD1Q16676 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
FOXD1Q16676 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FOXD1Q16676 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
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