Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
FOXD1Q16676 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FOXD1Q16676 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FOXD1Q16676 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
FOXD1Q16676 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FOXD1Q16676 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
FOXD1Q16676 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
FOXD1Q16676 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FOXD1Q16676 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FOXD1Q16676 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
FOXD1Q16676 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
FOXD1Q16676 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FOXD1Q16676 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
FOXD1Q16676 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms