Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.815e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.443e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.523e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.278e-11■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.738e-11■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.038e-11■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.278e-11■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.668e-11■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 STAT6-218ENST00000555641 1804 ntTSL 513.71□□□□□ -0.214e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 CLCN6-204ENST00000376491 927 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.594e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 CLCN6-203ENST00000376490 963 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.624e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.634e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 CLCN6-206ENST00000376496 2922 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.724e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 CLCN6-205ENST00000376492 1062 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.764e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 STAT6-204ENST00000538913 2879 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.774e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 STAT6-212ENST00000554764 2777 ntTSL 210.15□□□□□ -0.784e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 STAT6-220ENST00000556155 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.834e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.844e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 CLCN6-202ENST00000346436 5583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.964e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 STAT6-201ENST00000300134 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.174e-7■■■■□ 26.7
SRSF7Q16629 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.294e-8■■■■□ 26.6
SRSF7Q16629 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.474e-8■■■■□ 26.6
SRSF7Q16629 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.754e-8■■■■□ 26.6
SRSF7Q16629 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.84e-8■■■■□ 26.6
SRSF7Q16629 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.464e-8■■■■□ 26.4
SRSF7Q16629 DUSP9-203ENST00000477033 430 ntTSL 315.8■□□□□ 0.124e-8■■■■□ 26.4
SRSF7Q16629 FARP1-205ENST00000457029 602 ntTSL 57.26□□□□□ -1.254e-8■■■■□ 26.4
SRSF7Q16629 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.84□□□□□ -0.191e-323■■■■□ 26.4
SRSF7Q16629 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.231e-323■■■■□ 26.4
SRSF7Q16629 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 26.3
SRSF7Q16629 BCAR1-216ENST00000564170 552 ntTSL 417.33■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 26.2
SRSF7Q16629 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 210.6□□□□□ -0.713e-7■■■■□ 26.2
SRSF7Q16629 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.723e-8■■■■□ 26.1
SRSF7Q16629 HLF-204ENST00000572002 1251 ntTSL 310.1□□□□□ -0.793e-8■■■■□ 26.1
SRSF7Q16629 HLF-203ENST00000570962 1310 ntTSL 28.72□□□□□ -1.013e-8■■■■□ 26.1
SRSF7Q16629 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.153e-8■■■■□ 26.1
SRSF7Q16629 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.393e-8■■■■□ 26.1
SRSF7Q16629 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-8■■■■□ 26
SRSF7Q16629 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-10■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.385e-10■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.395e-8■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.425e-8■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.665e-8■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.75e-8■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.755e-8■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.795e-10■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.815e-10■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.865e-8■■■■□ 25.9
SRSF7Q16629 KIAA0907-203ENST00000368321 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.886e-13■■■■□ 25.8
SRSF7Q16629 KIAA0907-202ENST00000368320 4499 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.976e-13■■■■□ 25.8
SRSF7Q16629 KIAA0907-207ENST00000478002 1065 ntTSL 55.46□□□□□ -1.546e-13■■■■□ 25.8
SRSF7Q16629 ZNF12-202ENST00000394917 662 ntTSL 319.04■□□□□ 0.646e-7■■■■□ 25.8
SRSF7Q16629 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 25.8
SRSF7Q16629 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.026e-7■■■■□ 25.8
SRSF7Q16629 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-7■■■■□ 25.8
SRSF7Q16629 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.413e-7■■■■□ 25.8
SRSF7Q16629 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 05e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.17e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GPR75-ASB3-203ENST00000498475 736 ntTSL 518.91■□□□□ 0.627e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GPR75-ASB3-202ENST00000459916 556 ntTSL 418.91■□□□□ 0.627e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 218.44■□□□□ 0.542e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 CREB3L2-206ENST00000468127 596 ntTSL 317.37■□□□□ 0.377e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.377e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.087e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 315.16■□□□□ 0.027e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.297e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.36e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 PIGU-201ENST00000217446 1632 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.427e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 312.28□□□□□ -0.447e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 511.76□□□□□ -0.532e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 310.12□□□□□ -0.797e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.967e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 48.07□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.177e-8■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 PIGU-203ENST00000438215 509 ntTSL 37.19□□□□□ -1.266e-7■■■■□ 25.7
SRSF7Q16629 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 212.86□□□□□ -0.356e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 412.2□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 512.13□□□□□ -0.476e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 511.86□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 411.41□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 511.4□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 311.18□□□□□ -0.626e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.626e-7■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.14□□□□□ -1.753e-32■■■■□ 25.6
SRSF7Q16629 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 415.98■□□□□ 0.155e-10■■■■□ 25.6
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