Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAPC1Q16533 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAPC1Q16533 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAPC1Q16533 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAPC1Q16533 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAPC1Q16533 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms