Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZIC1Q15915 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZIC1Q15915 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZIC1Q15915 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZIC1Q15915 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZIC1Q15915 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZIC1Q15915 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms