Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCEA2Q15560 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCEA2Q15560 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCEA2Q15560 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCEA2Q15560 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCEA2Q15560 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCEA2Q15560 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms