Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYTH1Q15438 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYTH1Q15438 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYTH1Q15438 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CYTH1Q15438 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYTH1Q15438 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYTH1Q15438 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYTH1Q15438 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms