Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RCN1Q15293 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCN1Q15293 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN1Q15293 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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RCN1Q15293 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN1Q15293 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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RCN1Q15293 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN1Q15293 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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